白文选的犹豫和态度，白明修是一清二楚的。
在白文选参与的第一次南明小朝廷的朝会上，白明修就很干脆地抛出了“军改”的方针。
“……由澳洲的经验来看，军队在未来都将以火器化为主。火器会变得越来越厉害，不管是战马、盾车都无法阻挡强大的火枪和火炮。逆贼吴三桂此时已经在云南点兵，两路进发，估计最多三四个月，就会抵达阿瓦城下。如今之计，我军必须加速组建新军。为今之计，不能再拘泥于谁的部属谁的部属，大明若亡，谁都没有好结果。所以，本宫要将明军按照新法，编制为不同部队。”
白文选才不会信太子这样的话，在他看来这就是明显地夺兵权了，他出言反对道：“殿下，如您所言，与吴三桂的大战迫在眉睫，这个时候却要打散重组军队，用咱们都看不懂的东西去管军队，这个太过冒险了啊。”
面相只有十四岁的白明修双目含着精芒，望向白文选，道：“巩昌王，冒险与否，有本宫说了算。”
白文选觉得有些棘手，他还是想找些什么话来反对，但是他却看到，就连李定国都盯着自己，明显是站在了太子的那一边。
而朝会的与此同时，白明修授意手下赵旭、林正等人，将白文选的手下们给请到了一间大宅中，名义上是请各位同袍吃酒。可是吃到一半，白文选的部将张国用想要离开的时候，却被林正给阻拦了。
“干吗，还不让人走了吗？你们是什么意思？”张国用惊怒地道。
林正简单地道：“奉太子殿下之命，筹组大明新军，集合各部军官进行封闭培训，所有人不得私自离开集训地。”
张国用大怒：“这是将我们软禁了起来！”
林正一板一眼地道：“培训就是培训，之后学习成绩好，考核好，是能够升官的。”
这话的潜台词是，如果不好好干，不能让太子殿下满意，你也就别干了。
一时之间，阿瓦城居然再度显得有些混乱了，白文选军中几乎大小的首领都被抓了去，甚至李定国军中也有一些不听招呼的人，还想闹出乱子，最终被李定国亲自出面给提走了。
尽管李定国也觉得白明修的做法有一些冒险，但是现在李定国已经对白明修存在了一种迷信，甚至觉得白明修的雷厉风行手段，正是一位皇帝所需要的。而且在这个节骨眼上，整顿军队也确实是不可缺少的。
白明修有忠于自己的警卫连、铁炮足轻和蛮族兵作为“宪兵”，把不老实的家伙都收拾了一遍，基本上闹了一天的时间，明军只能老老实实地接受改编了。这个过程跟白明修想得差不多，并不算多么顺利，如果没有李定国的支持，他肯定搞不下去。
白明修清点明军装备，现有燧发枪2000支、火绳枪1000余支，至于那些三眼铳之类的东西，白明修直接从正规军序列里剔除掉了，而是扔给了蛮族兵。蛮族兵在山野之地作战，不需要组成什么线列，所以能一次击发的三眼铳之类的火枪就够用了。
依靠着强力手段，白明修还是拉出了一个近代化明军的架子。白明修很直接地给了这支军队一个新的番号——“大明复国军”。明军可战之兵员额为14000多人，白明修将其划分为了线列步兵、重步兵、长矛兵、山地步兵、弓箭手、游骑兵和炮兵。具体编组如下：
大明复国军陆军线列步兵第一团、第二团、第三团，装备燧发枪和火绳枪。每个团下属四个营，每营下属三个连，每个排32-36人。线列步兵总员额：3521人。
大明复国军陆军重步兵第一团、第二团，士兵披甲，使用的主要武器是刀盾一类冷兵器，编制跟线列步兵是类似的。重步兵总员额：2208人。
大明复国军陆军长矛兵第一团、第二团，装备2米以上长的长矛，士兵披轻甲。编制也跟线列步兵类似。长矛兵总员额：1860人。
大明复国军陆军山地步兵第一团、第二团，是由白明修的蛮族兵组成的，武器装备缅刀，以及一些中式火器。编制类似线列步兵，总员额1967人。
大明复国军陆军弓箭兵第一团，主武器为弓弩，编制上每个中队100名弓手，大队下属5个中队，弓箭兵第一团总员额1146人。
大明复国军陆军游骑兵第一团、第二团、第三团、第四团，主要披甲使用冷兵器的骑兵，编制上一个游骑兵团下属8个骑兵连，每个骑兵连约100人。骑兵总员额：3366人。
大明复国军陆军炮兵第一团，主要装备李定国和白文选军中各种弗朗机炮、虎蹲炮等威力不大的“轻型”火炮，加上白明修兑换的M1844拿破仑6磅炮，炮兵团编制下属炮兵营3个，员额仅有345人。
在白明修新组建的这支半近代又半中古的军队中，真正的主力是线列步兵团，白明修甚至还将铁炮足轻给拆开了，送到各部去做小军官，林正作为线列步兵第一团的团长。再就是四个骑兵团，白文选军中有大量的战马，正好方便了白明修组建了掩护线列步兵的骑兵团。骑兵可以执行冲击，并且在侧翼进行骚扰，还可以进行追击，是白明修现在战术里不可缺少的部分。
至于长矛兵，则是白明修跟古斯塔夫学的了。长矛兵组成的“野猪毛”阵可以有效的对抗骑兵，而且长矛兵列阵的威势还是很足的。
至于重步兵、弓箭手这类兵种，完全是因为白明修没有足够多的火枪，只能先行保留一些这样的中古军队。当他的火器保有量增加之后，白明修还会彻底地替换掉长矛兵，所以长矛兵、重步兵和弓箭手这种编制基本上只能算是暂时编制。
白明修为了打造明军的真正炮兵，还特意用所剩不多的金手指币，兑换了18门价格高达100币的拿破仑6磅炮，系统告知他，如果他之后兑换了相关图纸，这个价格还会降低一些。但好歹明军拥有了算是可以看的炮兵火力。