且说，郑成功获得厦门战役的胜利之后，积蓄力量准备渡海收复台湾，以此获取一个稳固的基地以便日后抗清。
在这一过程中，面对李存真军与满清的大战，郑成功始终无动于衷，将明李存亡看得如浮云一般轻巧。真的是“两耳不闻窗外事，一心只想打台湾。”还说这是隆武皇帝的遗命。
也就是在李存真就任吴王的时候，南明延平王、国姓爷、招讨大将军朱成功正在忙着与荷兰人一决雌雄。
让人没有想到的是，荷兰的筑城技术思路非常先进。特别是普罗文蒂亚城是两座棱堡组成的防御工事。荷兰军只有不到三百人，竟然顶着明郑数万人打。
经过十个月的激战，荷军上尉拨鬼仔阵亡，赶来救援的荷兰舰队被歼灭，热兰遮城失守，荷军穷途末路开城投降。
郑成功凭借人数优势终于从荷兰人手中收回了被占领了三十八年之久的台湾。这一战，足可以让郑成功成为民族英雄，永载史册。
由于忙于与荷兰人的战争，郑成功对李存真荣登吴王之位，就任骠骑大将军，虽然心里非常不满但是也无可奈何。
对于这个曾经对他卑躬屈膝的人，如今俨然已经爬到了自己头上，不仅成为了朝廷的骠骑大将军，而且成为了一字王的李存真，郑成功虽然没有说什么，可是明郑的其他将领却显得非常不满。
拿下台湾之后，很多人提议，掐断李存真与日本的贸易路线，甚至可以截断水真腊经由南海、台湾海峡到南京的海上运输路线，让李存真这“南洋海马仔”活不痛快！
但是，郑成功经过仔细考虑，否决了众人的提议。这不仅是因为李存真克复南京，在坐天山消灭了满清奴酋，有大功于朝廷。更是因为李存真和他之间的贸易，让明郑从中获取了巨大利益。
两家自从建立了贸易商路以来，明郑从明李处得到了茶叶、瓷器和丝绸等奢侈品，倒卖给弗朗机人大赚特赚；明李从明郑这里进口大量火药和炮弹更是让明郑获利颇丰。
这一买一卖，紧紧地将两家捆绑在一起，形成了一个以赚钱为核心的利益共同体。
在这种情况下，明郑和明李翻脸，哪怕是有龃龉，在经济上都会让明郑承受巨大损失，得不偿失。
而明李也是如此，李存真此时确实需要火药，不能和明郑掰腕子。
神州的上好的硝矿产地在河南。而李存真此时却没有能力进攻河南。因为短期内的战略目标就是以前郑成功设想的“封锁长江”。
此外，不去进攻河南的原因正如常琨所说，缺乏骑兵。明李步强骑弱，而河南又多是平原。明李的火枪兵打败以骑兵为主的北方军队不难，但是想要彻底消灭他们却不易。
搞不好这群北方骑兵会像苍蝇一样，时聚时散，持续消耗明军。明军一个不留神就可能会吃大亏。所以，李存真认为此事需要忍耐，百忍成金，等骑兵形成一定规模再北上不迟。
由于没有河南，便也就没有火药。李存真一方面勾结山西、河北皇商获得火药，分化满清内部势力，同时还是尽力拉拢明郑。毕竟江西、湖广、四川等战役，明军需要大量的火药。
此时，能够足量供给明李火药的只有郑成功集团。此时，在整个东亚地区盛产火药的正是琉球王国和日本。特别是琉球王国既盛产硫磺又盛产硝，他们生产的火药质量上乘，价格实在。而且他所处的位置能够很好地供应周边的国家和势力，包括日本、朝鲜和荷兰。
明郑集团手握日本、琉球贸易通道，就连荷兰、西班牙等国想要和日本贸易都需要经过明郑，更不要说别人了。因此，明李从明郑进口火药反而价格能便宜一些，加上数量大得惊人，很好地拉住了明郑。
火药这东西，荷兰、葡萄牙、西班牙和英国也都可以提供，但是李存真对泰西极不信任，在南洋的时候就被英国坑过，此时即便是面对以信誉著称的海上马车夫李存真认为怕是也不牢靠。毕竟他跟荷兰的恩怨世人皆知。
由于明李和明郑在经济上捆绑在一起，这让一代英雄郑成功不要说在与李存真翻脸的问题上显得犹豫不决，就连搞小动作也有顾忌。
事实上，往前说一年半，明郑方面很多人在李存真控制南京，特别是南京之战击败李率泰的六万大军的时候就提出要效法孙权奇袭荆州的策略一举夺取福建，如果可以的话甚至可以夺取浙江。这些人以黄昭、萧拱宸等人为代表。
黄昭说道：“李存真之所以能够拿下南京全是因为国姓爷兴兵北伐且又在厦门血战当中击败满清安南将军章佳·达素，导致整个满清在东南地区兵力空虚，这才给了李存真可乘之机，一击得手偷取南京。”
黄昭所说其实与事实正好相符。虽然说李存真作为一名教育学博士，根本不可能清晰而详细地了解南明的历史，但是李存真毕竟是个穿越者，崇拜民族英雄郑成功。所以了解一些与郑成功相关的历史，从郑成功起兵抗清、北伐南京、厦门大战、收复台湾到壮志未酬身先死，一桩桩一件件，李存真都能如数家珍。故而，作为穿越者的他提前洞察天机，精心布局，瞅准时机果断出手，这才一举占据南京，震动天下。
占据了南京，这是一次战略进攻。使明清争霸没有经过战略僵持，直接攻守易位。
此时的郑成功离开了江南，头脑异常清醒，认为手下诸将的意见没有太大意义，他说道：“你们说李存真是占了我们的便宜？”
黄昭回答：“正是！”
郑成功轻笑一声说道：“我们去打南京没打下来，人家打下来了，你说南京是你的？”
听得郑成功如此说法，黄昭一时语塞不知道该怎么回答。
萧拱宸却说道：“但是好处也不能让他一个人全吞了去啊！扬州、镇江在不就是苏州，给一个总不过分吧？”
郑成功听罢大笑，说道：“天底下还有讲理的人吗？你说李存真拿下南京是图现成，拿下南直隶是图现成，人家能承认吗？你又凭什么这么说呢？现在又去讨要东西，你当我们是什么？乞丐吗？
南直隶都在人家手里，你要个苏州又有何用？
再说，那你们让我去攻打福建浙江，如果打下来了，李存真是不是也可以和你们一样说我是占了他的便宜？毕竟如果没有他南京城下大败李率泰，我们不可能从容地攻打福建、浙江。
到时候你们说怎么分？人家给了我苏州、扬州，放过来管我要泉州、宁波，我给是不给？”
郑成功说到这里众人便全不吱声了。
郑成功说道：“人家李存真是动用了自己的人马，一刀一枪流血牺牲从满清手里抢过来的，你却说是你的？”
国姓爷说罢，众将再没有人言语。
明郑没有进攻福建和浙江。其实不是不好意思占李存真便宜，而是在南京之战后郑成功认为自己在陆地上没有办法与满清对抗。
何况，李率泰、史继功虽然兵败南京，但是满清的汉军八旗大半、满八旗四千人还都在福建完整齐备。绿营也没有全军覆没。靖南王耿继茂的实力虽然有所削弱但是并没有伤筋动骨。福建清军实力不可小觑。
如果趁着李存真在南京城下击败闽浙总督李率泰的空档，明郑进攻福建，那真的就是在啃骨头。搞不好到了最后，明郑在福建与满清拼个两败俱伤，李存真反而如众位将领所说“图现成”。若如此岂不是真的可恨？
因此，明郑继续准备攻打台湾事宜，郑成功对李存真取得的所有成就无动于衷。即便是李存真诛杀顺治，荣登吴王宝座，明郑也没有一个人来庆贺。
明郑的没有态度清晰地表明了态度。
李存真也没空搭理郑成功。李存真心道：本以为你是民族英雄，可是没有想到心眼这么小。
于是，李存真不再抱着联合明郑的心思，退而求其次——只要你别当我的猪队友，别坑我，我就满足了。
从那以后，明郑和明李确真是“政治冷，经济热”——两家虽然在经济上打得火热，拼命搂钱，但是在政治上却摆出一副老死不相往来的架势。
甚至在郑家，甘辉等受过明李恩惠的将领都隐隐遭遇“歧视”。
这种状况持续了差不多两年。直到……一个噩耗传来……